Чак Бартовски, обычный парень, работает системным администратором, он «компьютерный червь», и поэтому у него серьезные проблемы в реальном общении. История Чака начинается в день его рождения. Он получает электронное письмо от бывшего однокурсника по Стэнфорду, ныне агента ЦРУ. Приятель бесследно исчезает, а письмо автоматически загружает в память Чака содержимое целого сервера с секретной информацией о самых опасных преступниках и террористах, которых разыскивает разведка США.
Теперь Чак вынужден работать на АНБ и ЦРУ и помогать им в розыске преступников. Самое интересное, что информацию теперь он получает, в виде флэшбеков-головоломок, которые самостоятельно загружаются ему в голову.